-This is a very simple implementation of the KSP applied to
-multi-target tracking. It is dubbed Multi-Tracked Paths since it
-differs a bit from the standard KSP. It works with negative edge
-length and stops when it can not find any path of negative length,
-instead of fixing the total number of paths to a constant K.
+* INTRODUCTION
+
+This is a very simple implementation of a variant of KSP applied to
+multi-target tracking dubbed "Multi-Tracked Paths" (MTP).
+
+It works with negative edge length and stops when it can not find any
+path of negative total length, instead of fixing the total number of
+paths to a constant K.
+
+* INSTALLATION
+
+This source code should compile with any C++ compiler. Just run "make"
+and execute the mtp executable. It should print the optimal detected
+trajectories, and save into graph.dot the result graph and
+trajectories in the dot syntax. You can produce a pdf from the latter
+with
+
+  dot < graph.dot -T pdf -o graph.pdf
+
+* DESCRIPTION
 
 The two main classes are MTPGraph and Tracker.
 
 
 
   for(int l = 0; l < nb_locations; l++) {
     for(int k = 0; k < nb_locations; k++) {
-      tracker->set_allowed_motion(l, k, abs(l - k) <= motion_amplitude);
+      tracker->allowed_motion[l][k] = abs(l - k) <= motion_amplitude;
     }
-    tracker->set_as_entrance(0, 1);
-    tracker->set_as_exit(nb_locations - 1, 1);
+    tracker->entrances[0] = 1;
+    tracker->exits[nb_locations - 1] = 1;
   }
 
   tracker->build_graph();
 
   for(int t = 0; t < nb_time_steps; t++) {
     for(int l = 0; l < nb_locations; l++) {
-      tracker->set_detection_score(t, l, detection_score(-1, 0.95));
+      tracker->detection_score[t][l] = detection_score(-1, 0.95);
     }
-    tracker->set_detection_score(t, nb_locations/2, detection_score(1, 0.95));
+    tracker->detection_score[t][nb_locations/2] = detection_score(1, 0.95);
   }
 
   tracker->track();
 
   _nb_locations = nb_locations;
   _nb_time_steps = nb_time_steps;
 
-  _detection_score = allocate_array<scalar_t>(_nb_time_steps, _nb_locations);
-  _allowed_motion = allocate_array<int>(_nb_locations, _nb_locations);
+  detection_score = allocate_array<scalar_t>(_nb_time_steps, _nb_locations);
+  allowed_motion = allocate_array<int>(_nb_locations, _nb_locations);
 
-  _entrances = new int[_nb_locations];
-  _exits = new int[_nb_locations];
+  entrances = new int[_nb_locations];
+  exits = new int[_nb_locations];
 
   for(int l = 0; l < nb_locations; l++) {
-    _entrances[l] = 0;
-    _exits[l] = 0;
+    entrances[l] = 0;
+    exits[l] = 0;
     for(int m = 0; m < nb_locations; m++) {
-      _allowed_motion[l][m] = 0;
+      allowed_motion[l][m] = 0;
     }
   }
 
   for(int t = 0; t < _nb_time_steps; t++) {
     for(int l = 0; l < _nb_locations; l++) {
-      _detection_score[t][l] = 0.0;
+      detection_score[t][l] = 0.0;
     }
   }
 
 Tracker::~Tracker() {
   delete[] _edge_lengths;
   delete _graph;
-  deallocate_array<scalar_t>(_detection_score);
-  deallocate_array<int>(_allowed_motion);
-  delete[] _exits;
-  delete[] _entrances;
-}
-
-void Tracker::set_allowed_motion(int from_location, int to_location, int v) {
-  ASSERT(from_location >= 0 && from_location < _nb_locations &&
-         to_location >= 0 && to_location < _nb_locations);
-  _allowed_motion[from_location][to_location] = v;
-}
-
-void Tracker::set_as_entrance(int location, int v) {
-  ASSERT(location >= 0 && location < _nb_locations);
-  _entrances[location] = v;
-}
-
-void Tracker::set_as_exit(int location, int v) {
-  ASSERT(location >= 0 && location < _nb_locations);
-  _exits[location] = v;
-}
-
-void Tracker::set_detection_score(int time, int location, scalar_t score) {
-  ASSERT(time >= 0 && time < _nb_time_steps &&
-         location >= 0 && location < _nb_locations);
-  _detection_score[time][location] = score;
+  deallocate_array<scalar_t>(detection_score);
+  deallocate_array<int>(allowed_motion);
+  delete[] exits;
+  delete[] entrances;
 }
 
 void Tracker::build_graph() {
   int nb_motions = 0, nb_exits = 0, nb_entrances = 0;
 
   for(int l = 0; l < _nb_locations; l++) {
-    if(_exits[l]) nb_exits++;
-    if(_entrances[l]) nb_entrances++;
+    if(exits[l]) nb_exits++;
+    if(entrances[l]) nb_entrances++;
     for(int m = 0; m < _nb_locations; m++) {
-      if(_allowed_motion[l][m]) nb_motions++;
+      if(allowed_motion[l][m]) nb_motions++;
     }
   }
 
     // frame to the sink
     _nb_locations * 2 +
     // The edges from the source to the entrances and from the exists
-    // to the sink (in every time frames but the first and last)
+    // to the sink (in every time frames but the first for the source,
+    // and last for the exits)
     (_nb_time_steps - 1) * (nb_exits + nb_entrances) +
     // The edges for the motions, between every pair of successive
     // frames
   _edge_lengths = new scalar_t[nb_edges];
 
   // We put the in-node edges first, since these are the ones whose
-  // lengths we will have to change according to the detection score
+  // lengths we will have to set later, according to the detection
+  // scores
 
   for(int t = 0; t < _nb_time_steps; t++) {
     for(int l = 0; l < _nb_locations; l++) {
         e++;
       } else {
         for(int k = 0; k < _nb_locations; k++) {
-          if(_allowed_motion[l][k]) {
+          if(allowed_motion[l][k]) {
             node_from[e] = 1 + (2 * (t + 0) + 1) * _nb_locations + l;
             node_to[e] =   1 + (2 * (t + 1) + 0) * _nb_locations + k;
             _edge_lengths[e] = 0.0;
 
   for(int t = 0; t < _nb_time_steps; t++) {
     for(int l = 0; l < _nb_locations; l++) {
-      if(t > 0 && _entrances[l]) {
+      if(t > 0 && entrances[l]) {
         node_from[e] = source;
         node_to[e] =   1 + (2 * (t + 0) + 0) * _nb_locations + l;
         _edge_lengths[e] = 0.0;
         e++;
       }
-      if(t < _nb_time_steps - 1 && _exits[l]) {
+      if(t < _nb_time_steps - 1 && exits[l]) {
         node_from[e] =   1 + (2 * (t + 0) + 1) * _nb_locations + l;
         node_to[e] = sink;
         _edge_lengths[e] = 0.0;
   int e = 0;
   for(int t = 0; t < _nb_time_steps; t++) {
     for(int l = 0; l < _nb_locations; l++) {
-      _edge_lengths[e++] = - _detection_score[t][l];
+      _edge_lengths[e++] = - detection_score[t][l];
     }
   }
   _graph->print_dot(os);
   int e = 0;
   for(int t = 0; t < _nb_time_steps; t++) {
     for(int l = 0; l < _nb_locations; l++) {
-      _edge_lengths[e++] = - _detection_score[t][l];
+      _edge_lengths[e++] = - detection_score[t][l];
     }
   }